1. 蛋白纯化用的GE公司的镍柱用过后下端忘记盖好 柱子还能在用吗
预装柱:如果没有干掉的话没有问题的。如果干掉了要用他们推荐的条件下重新活化。如果是自己装填的重新装柱就行了
2. 蛋白纯化过镍柱以后为什么会沉淀啊
蛋白浓度过高的时候,会发生聚集而沉淀。有些不易溶蛋白随着镍柱的专富集作用就会沉淀属。
由于不知道你实验目的,简单认为你要纯化表达的蛋白,解决方法:
1. 换更强亲水肽段载体pet50(从酶切链接开始做),但是这样会在表达出来蛋白中增加非目的蛋白成分
2. 不要用最佳浓度咪唑洗脱,用稍差一些的,这样洗脱出来蛋白速度慢,浓度低,但是看你是否对浓度要求了。
3. 重新设计引物把输水片段删掉,这样增加可溶性再表达纯化
4. 考虑在沉淀里加入稀盐,促溶。但不知对你实验是否有影响
3. 蛋白纯化镍柱和填料的购买
就做一种并且要求不是很高的话买个国产的预装柱就行了,方便好用还便宜,大小根据你的需要选择。我买的七海复泰的,载量是20mg/ml,价格大概在70块钱/ml吧
4. 镍柱纯化蛋白后,镍柱结块了,怎么办
柱子的填料已经变形,要超声处理,复性,加氯化镍再生。
5. ni柱纯化蛋白的原理,镍柱纯化总有一条杂蛋白怎么办
his标签与镍金属离子的结合作用是ni柱纯化蛋白的原理。
总有一条杂蛋白,有可能是非特异性结合。你可以尝试优化蛋白洗脱方法,将你的目的蛋白与杂蛋白进行分离。
6. 用镍柱纯化过得蛋白还能再进行离子交换吗
你可以试试。只是镍柱本质上也是靠电荷吸引力来纯化蛋白,和阴离子交换层析有些类似,那些镍柱无法去除的杂蛋白能否被阴离子交换层析去除,可能需要打个问号。不过两次纯化效果应该比一次好吧。
7. 蛋白过镍柱纯化的原理和步骤是什么
Ni柱中的氯化镍可以与有HIs(组蛋白)标签的蛋白结合,也可以与咪唑结合。
步骤是:过柱子前可以选择Ni柱重生,也就是往柱子里倒氯化镍,一个柱长体积就行了,然后平衡柱子,拿你自己的buffer,给蛋白提供最适的环境,我一般平衡4个柱长,然后蛋白上样,你可以让他自己挂,这样挂柱子的效果好一些,如果流速太慢,可以加个恒流泵,但是一定不能太快,太快挂柱效果差,当然你也可以选择循环挂柱,就是恒流泵的一头接你装蛋白的烧杯,从柱子中留下来的液体还用同一个烧杯接回去。挂完之后,按理想来讲,你的蛋白在Ni柱中与Ni就结合了,杂蛋白多数在烧杯里,留下来了,当然肯定有少量杂蛋白也挂上了,这时候你要梯度洗脱,拿咪唑和你的buffer配,一般从0
20mM
40mM。。。。100mM这样洗脱(当你不知道你的蛋白大概在什么时候出来的时候)我指的是咪唑的终浓度。咪唑加入之后,会和蛋白争夺与Ni的结合位点,杂蛋白、你的目的蛋白,会在不同的浓度被洗脱下来,洗完之后,你可以用200mM咪唑洗柱子,清理一切蛋白,然后平衡几次,是否选择重生你自己定咯~然后放上20%乙醇保存柱子就可以咯~
过的蛋白用不同的管子收下,然后SDS-page检测在哪个管子里。
这是我的经验,楼主可以多方面参考下别人的。喜欢推荐我的答案哦,~\(≧▽≦)/~
8. 镍柱纯化蛋白没有挂柱是什么原因
可能有多种原因导致 蛋白不挂柱子。
例如:
因为His标签被包到了蛋白三维结构里面。镍介质无法接触His 标签;
纯化工艺不利于结合作用发挥,例如咪唑;
蛋白不稳定,标签掉落。
…
9. 带HIS蛋白用镍柱纯化后的保存问题
你好,蛋白保存是个比较棘手的问题,就我的理解来讲:
蛋白的保存很大程度上回依赖于蛋白本身的结答构稳定性,其次和保存条件优化有关;
尽量避免蛋白的反复冻融,这会对蛋白的结构和活性造成破坏;
像你说到的第二天就要用,根本没必要放在-70℃低温,一般来讲,尽量安排好实验周期,在3天内用完蛋白(4℃保存)是理想条件;
如果不得不保存,要分装,留下马上就用的放在4℃,其他放低温,每次取1只;如果有冻干机,冻成干粉再放到-70比液态低温更好,再溶解也会好很多(但很多蛋白还是会有失活问题);
关于保护剂,如果蛋白稳定性不强,一般会加甘油(5%-50%浓度)和叠氮钠(抑菌),这样一来,取出时,不得不做透析或脱盐,以去除甘油和叠氮钠,会带来损失,相比而言,冻干粉就好很多;
关于咪唑的去除问题,如果确信咪唑的存在对你后续的实验没影响,可以不去;但实际上,很多实验都会受到咪唑的影响,或者说一旦实验有疑问,你就无法判定是否是因为咪唑,所以建议你去咪唑,去咪唑的方式包括:透析、浓缩管离心、脱盐柱。个人认为,去除效率、最省时、蛋白回收率最高的办法是脱盐柱。
我目前想到的就这么多,欢迎继续讨论,祝实验顺利!
10. 蛋白过镍柱纯化的过程 我是初学者,所以麻烦大家给的详细一点 谢谢啦!
见http://..com/question/292063616.html或
镍柱分离纯化
固定金属离子亲和柱主要用于金属螯化离子。位于许多蛋白中的组氨酸残基将会和许多金属离子,例如锌。铜,镍,铁等形成复合物。因此,该柱料能选择性螯合一些具有组氨酸残基的蛋白质。但是半胱氨酸和咯氨酸残基也能和固定化金属螯和。但是亲和力比组氨酸要弱。所以,结合的强度是和缓冲液的PH和金属离子决定的。
金属螯和柱料主要是由亚氨基的乙酰乙酸成分耦联琼脂糖柱料,借助醚长生7个原子的空间。
全部容量:24-30um的含有zn的干胶
柱料结构:6%的高铰链的琼脂糖
柱料大小:45-165um
平均微粒:90um
直流速度:25度/0.1MPa/30倍柱床/5厘米高度/每小时可达700厘米
最大压强:0.3MPa
PH变化:长期3-13
短期2-14
化学稳定:通用含水缓冲液
0.01M盐酸,1.0M NAOH, 20%乙醇(保存7天)
物理性质:可以忽略在PH或者离子变化下的体积变化
耐热性能:121度下0.1M乙酸钠作用半小时
金属螯和柱料保存于事先填充于20%乙醇。所以要搅拌驱除20%乙醇溶液。换成去离子水。比例是25%去离子水和75%处理胶。
处理金属螯和柱料:
1 平衡所有用到的材料于室温。
2 搅拌金属螯和柱料
3 倒水进柱子,驱除气体。用无离子水液封几厘米。
4 将金属螯和柱料连续倒进柱子,用玻璃棒支撑柱壁防止气泡形成。
5 然后立即用无离子水液封,装上柱盖,连接上泵。
6 打开柱子底部的开关,然后调节泵的流速。通常是不超过0.3MPa的。
7 经过一个稳定的柱床填鸭后,维持填压速度为3个柱床。
使用adaptor
1 经过上溯填鸭后,关闭柱床下面开关,移开上面的薄膜,小心的加上去离子水进行液封。
2 一定角度插入adaptor,确保没有气泡。
3 确保所有的连接都没有问题,柱子/泵/样品接受器
4 倾斜插入活塞确保没有气泡和管道充满液体。利用活泵正反向的流动确保没有气泡。
5 固定adaptor,打开柱子开关,开始缓冲液的流动。先以填鸭的速度直到柱床稳定后。
固定金属离子:
金属螯和柱料通过水来螯和金属的,避免发生沉淀在胶上。
1 确保柱子已经平衡好。如果有必要可以洗2个柱床(去离子水)
2 选择金属离子和0.1-0.3M中弱性酸。例如铁离子PH 3左右就好,避免形成沉淀和共沉。
3 加入一倍柱床的金属离子溶液
4 5倍柱床的去离子水洗涤
5 至少2倍柱床的平衡缓冲液
结合:
发生于PH5.5-8.5之间.最强反映发生于最后
初始缓冲液的选择决定于金属离子和样品的结合性质。乙酸钠或者磷酸钠是比较好的缓冲液中不能使用EDTA或者柠檬酸盐
最通用缓冲液:
0.01-0.2M磷酸钠
0.05M乙酸钠
强烈推荐加入0.15-0.5M NaCl用于防止离子交换。
通常如果不知道一个蛋白的结合能力,最好的就是使用锌离子和中性的磷酸或者乙酸盐,同时含有0.15-0.5M NaCl
去垢剂不会影响蛋白质的结合能力
金属离子的取代意味着蛋白发生了结合。这种现象可以通过颜色来决定
洗脱蛋白:(3种方法)
1 降低PH(一步或者分步),大部分蛋白溶解于PH4-6最终3-4是可容的。可选择柠檬酸盐,磷酸或者乙酸盐。
2 逐步提高咪唑的浓度(0-0.5M),梯度变化最好是在初始缓冲液的PH范围。
3 加入EDTA或者EGTA可洗脱蛋白质。但是不是通用的。
利用离心或者重力作用纯化组氨酸位点蛋白
通过上镍进行选择性结合含有组氨酸位点蛋白,然后利用含有咪唑的缓冲液洗脱蛋白。
以下的实验是为了最大化将组氨酸位点蛋白结合到金属螯和柱料,然后确保能够洗脱下来。当结合和洗脱的条件尚未明了时,这些方法也是很好用的。
为了获得高纯度的蛋白,必须摸索咪唑的缓冲液在样品上柱和洗脱时的浓度。通常使用10mM-500mM范围的咪唑的缓冲液进行剃度洗脱,然后通过收集和SDS-PAGE 蛋白电泳确定洗脱浓度。
为了纯化不可容的含有his位点的蛋白质,(包含体),可以在变性条件下进行。利用8M尿素或者6M盐酸呱进行溶解蛋白。
样品处理:
样品要经可能溶解,避免出现堵塞现象,所以可以利用0.45uM虑膜过滤杂志
如果样品时溶解于20mM磷酸缓冲液中(含有0.5M Nacl,PH7.4),必须调整PH到7-8。
上柱前准备:
洗柱料:
1 亲柔震动胶瓶充旋胶料
2 利用吸管吸出足量柱料用以纯化目的。每毫升柱料可以吸纳5毫克蛋白
3 500g 离心2-5分钟,沉淀柱料。
4 小心去除上清
5 加入5倍体积去离子水,充分振荡柱料。可以倒置来回5分钟,不要机械搅拌。
6 再次500g 离心2-5分钟,沉淀柱料。
7 再次小心去除上清
挂镍:
1 加入0.5倍柱床体积0.1M硫酸镍,充分振荡柱料。可以倒置来回5分钟,不要机械搅拌。
2 500g 离心2-5分钟,沉淀柱料。
3 小心去除上清
洗柱:
1加入5倍体积去离子水,充分振荡柱料,来回倒置5分钟
2 500g 离心2-5分钟,沉淀柱料。
3小心去除上清
4 再洗两次柱料(一共3×5柱床去离子水)
5 最后用一倍体积起始缓冲液充旋柱料(20mM Na2HPO4 /0.5MnaCl/10mM咪唑/PH7.4)
利用离心来纯化:
上样:
1 在起始缓冲液中加入样品,然后使整体胶浓度达到50%
2 亲柔搅拌,室温离心5-30分钟,结合能力取决于蛋白和样品浓度。
3 500g 离心2-5分钟,沉淀柱料。
4 取出上清。部分用于SDS-PAGE 蛋白电泳
洗胶:
1 加入5倍体积起始缓冲液,搅拌5分钟
2 500g 离心2-5分钟,沉淀柱料。
3取出上清。部分用于SDS-PAGE 蛋白电泳
4再洗两次柱料(一共3×5柱床起始缓冲液)。记得取出上清,部分用于SDS-PAGE 蛋白
电泳
洗柱:
1 加入2倍体积洗脱缓冲液(20mM Na2HPO4 /0.5MnaCl/10mM咪唑/PH7.4)搅拌5分钟
2再次500g 离心2-5分钟,沉淀柱料。
3再洗四次柱料(一共5×2柱床洗脱缓冲液)。记得取出上清,部分用于SDS-PAGE 蛋白电泳,280nM吸光值,ELISA,WESTERN
利用流速和重力纯化:
1 在柱子底部加上滤器
2 加水排气
3 加柱帽,去除残余水。推荐是最多2 Ml柱料就可以了
样品结合:
1 倒胶进入柱子
2 小心上样,用波棒室温搅拌5-30分钟
3 打开柱帽,收集流出峰用于分析
洗胶:
1 加入5倍体积起始缓冲液,收集流出液用于SDS-PAGE 蛋白电泳
2再洗两次柱料(一共3×5柱床起始缓冲液)。记得取出上清,部分用于SDS-PAGE 蛋白
电泳
洗柱:
1 加上柱帽,加入2倍体积洗脱缓冲液(20mM Na2HPO4 /0.5MnaCl/10mM咪唑/PH7.4)搅拌5分钟。打开柱帽,收集流出峰
2再洗四次柱料(一共5×2柱床洗脱缓冲液)。记得取出上清,部分用于SDS-PAGE 蛋白电泳,280nM吸光值,ELISA,WESTERN
注意:0.5M咪唑的280nM吸光值=0.5
常见问题:
1 样品太粘稠
答:核酸存在影响,可以继续超声,加入RNA酶至10ug/ml DNA酶至5ug/ml。然后冰浴1
0-15分钟。或者也可以用注射器来回充旋。这样可以防止堵塞柱料。
2 平衡时样品洗脱了下来
答: 检查PH和缓冲液成分,如果缓冲液成分不正确,EDTA加入,强还原剂加入,都会导致这个现象出现。
加大胶的量,如果胶料承载能力过头,也绘出出现这现象。
准备新鲜的柱料,如果柱料断裂,也挂不上蛋白。
3 在洗脱液中不含有组氨酸蛋白
答:如果SDS-PAGE 蛋白电泳已经发现蛋白存在于超声液中
超声可能不完全。可以用显微镜观察超声情况。AD260/280比值。(通常是超声前将10mg/ml溶菌酶加入25mM Tris-HCL,PH6-8),避免发泡以降解融合蛋白。
蛋白可能是是包含体,可以使用4-6M盐酸呱或者4-8 M尿素溶解。
尿素溶解的可以进行SDS-PAGE 蛋白电泳,盐酸呱溶解的不可以进行SDS-PAGE 蛋白电泳,必须换缓冲液。
洗脱液浓度太稀,可以加大咪唑浓度或者降低PH 来决定最佳洗脱条件如果在平衡前的洗柱发现了目的蛋白,证明起始缓冲液中的咪唑浓度太高,可适当降低。
4 考马氏亮蓝或者银染发现多条带
答:加入蛋白激酶抑制剂。可能是蛋白降解。用凝血酶切割前必须去除丝氨酸蛋白酶抑制剂采用梯度咪唑来洗脱蛋白。在平衡洗脱液中加入10mM咪唑可以洗脱大量杂质而不会洗脱融合蛋白。低于500mM咪唑可以洗掉绝大部分杂质。
在洗脱步奏往起始缓冲液加入去垢剂(2%TRITON x-100或者2%Tween20)50% 葡萄糖,20mM B-巯基乙醇。记得杂质通常没有特意结合能力,可以改变缓冲液来洗脱。
如果杂志和目的蛋白有相同结合能力,那就不能用于纯化。因此可以使用别的纯化系统,例如含有GST尾巴就用谷胱甘肽琼脂糖4B
柱料再生,清洁和保存
柱料再生:
1 使用0.05M EDTA,0.5M NaCl来洗脱镍离子。然后用3柱床的0.5M NaCl来洗干净EDTA
2如果是铁离子可以用0.05M EDTA泡过夜
3 这一步可以洗脱上面未能洗脱的残余结合蛋白
清洗柱料:
1 0.5倍柱床2M NaCl,反向洗脱10-15分钟
2 1M NaOH洗1小时去除残余蛋白
3 每一步都要用3倍柱床起始缓冲液清洗
4 4倍柱床70%乙醇洗脱强亲水蛋白和脂类蛋白。
也可以使用2倍柱床去垢剂。0.1-0.5%非离子去垢剂溶于0.1M乙酸。浸泡1-2小时。最后用5个柱床的70%乙醇去除去垢剂。
清洁:
1 尽可能去除微生物
2 0.5-1M NaOH反向流动半小时
3 再用3-5倍柱床消毒的起始缓冲液平衡
4 这个清洁步奏不一定能够提高纯化能力
保存:
长期保存于20%乙醇或者0.01M NaOH 于4度
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